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【ESMO IO 2022】新冠病毒对肿瘤是否有影响?研究人员来回答!

2022年12月14日
编译:肿瘤资讯
来源:肿瘤资讯

编者按:2022年欧洲肿瘤内科学会免疫肿瘤学大会(ESMO IMMUNO-ONCOLOGY)于12月7~9日在瑞士日内瓦和线上同步召开。SARS-CoV-2在不断变异,致病性发生了很大变化。病毒是否会对肿瘤发生、进展、复发产生影响,及影响的深入如何,尚不明确。印度研究人员R. Kumar通过生物信息分析,得出SARS-CoV-2通过支持肿瘤微环境中的致瘤条件和促进肿瘤细胞迁移,在肿瘤复发中发挥重要作用。【肿瘤资讯】编译了大会上的这份摘要,可供参考。

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背景

SARS-CoV-2是引发全球大流行的冠状病毒变种,感染了全球1200多万受害者。SARS-CoV-2与其他病毒类似,与宿主蛋白相互作用,并在宿主细胞内复制其基因组。因此,病毒宿主蛋白-蛋白相互作用(PPI)的鉴定有助于预测病毒的行为及其与其他致病途径的重叠。已知有几种病毒与肿瘤活化途径密切相关,成为致瘤突变甚至转移复发的起点。病毒的这种致癌性质鼓励研究人员探索SARS-CoV-2感染期间和之后患者的差异表达基因(DEG)和相关富集途径。

方法

GEO数据库由Gordon等和Blanco Melo等建立,可获得新冠患者RNA Microarray相关数据,以此作为COVID-19差异表达数据集。使用Cytoscape创建了从GEPIA数据库和两种疾病的个体网络获得的肺癌差异表达数据集,将整个人类基因-基因相互作用作为背景(HIPPIE数据库)。

结果

研究人员通过网络分析确定了SARS-CoV-2的287个DEG、肺腺癌的4242个DEG和肺鳞状细胞癌的5958个DEG。使用Leiden聚类算法对这些网络进行聚类;对两种疾病中具有重叠基因的聚类分析,采用CytoKEGG工具的路径富集以及GOC工具(基于PANTHER)的基因本体分析。这些分析揭示了71个基因参与肿瘤免疫逃逸、肿瘤增殖和免疫信号传导的6个重要途径,即TLR途径、cAMP信号传导途径、VEGF信号传导途径,G蛋白耦联受体信号传导途径、IL-6扩增途径,以及MAPK信号传导途径。 

结论

研究结果表明,SARS-CoV-2通过支持肿瘤微环境中的致瘤条件和促进肿瘤细胞迁移,在肿瘤复发中发挥重要作用。

参考文献

https://doi.org/10.1016/j.iotech.2022.100340

责任编辑:车芸华
排版编辑:车芸华

               
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评论
2022年12月14日
刘海燕
丹东市人民医院 | 肿瘤内科
SARS-CoV-2通过支持肿瘤微环境中的致瘤条件和促进肿瘤细胞迁移,在肿瘤复发中发挥重要作用
2022年12月14日
周会会
济宁市第一人民医院 | 肿瘤科
研究结果表明,SARS-CoV-2通过支持肿瘤微环境中的致瘤条件和促进肿瘤细胞迁移,在肿瘤复发中发挥重要作用。
2022年12月14日
任革
陕西中医药大学附属医院 | 肿瘤内科
还只是个推测