您好,欢迎您

【阔然开朗】ROS1基因重排是MSS结直肠癌患者一组罕见驱动

2022年10月31日
来源:肿瘤资讯

现有研究表明ROS1基因融合是肺癌的驱动基因之一,且在肺癌中目前有相关获批靶向药物及适应症[1.2]。但在结直肠癌中关于ROS1基因融合报道有限,更多是集中在治疗相关的案例报道或小样本分析[3.4],对于ROS1基因融合的结直肠癌患者占比及分子特征等尚不明确。

本文[5]通过对40589名结直肠癌患者队列的测序数据进行分析发现0.084%(34/40589)患者检出ROS1基因融合,这一占比远低于泛实体肿瘤(0.23%)[6]。现有数据表明在实体瘤中肺癌的ROS1基因融合占比最高(0.68%),其次是胶质瘤(0.40%)[7]。这34例患者的ROS1基因融合伴侣最常见的是GOPC基因,其次是TTC28基因,这与肺癌ROS1常见融合伴侣存在差异。其中有14例由于部分原因无法确定其融合伴侣。
image1.png
对于ROS1基因的融合断点位置分析发现其中有17个融合断点是位于ROS1基因的第34号内含子区域,6个位于第32号内含子区域。4个位于第31号内含子区域,3个位于第33号外显子区域,第30号和第35号内含子各有一例,2例位于外显子区域。对其中已知融合伴侣进行具体分析发现14个融合是由于染色体内重排产生的融合,5个是染色体间重排导致的融合。
image2.png
对结直肠癌患者的分子景观中分析发现在ROS1基因融合和野生型这两组中APC、TP53、KRAS变异均是最常见的基因变异,其中APC和TP53变异的人群频率相似,KRAS突变人群频率ROS1融合患者远低于ROS1野生型患者。两组中的TMB-H和LOH-H占比相似,但在MSI-H患者中没有检出ROS1基因重排,97.1%(33/34)的ROS1基因融合出现在MSS结直肠癌患者中,这表明ROS1融合在MSS结直肠癌中是一组独特亚型。
image3.png
一名右半结直肠癌患者免疫组化和一代测序结果显示KRAS、NRAS、BRAF野生型,错配修复蛋白(MMR)未发生缺失,先后采用贝伐珠单抗联合化疗方案和西妥昔单抗联合化疗方案进行治疗,在出现腹膜和肝转移后进行基因检测,具体变异类型如图,其中有GOPC-ROS1基因融合,采用克唑替尼治疗一段时间后发生进展,再次基因检测发现KRAS Q61H基因变异,怀疑KRAS突变是患者克唑替尼药物治疗耐药机制。采用TAS-102治疗,但患者肿瘤迅速恶化。

image4.png

本文通过对大样本的结直肠癌患者队列进行分析发现在0.084%的结直肠癌患者中出现ROS1基因融合,并且对融合断点和伴侣进行具体分析。从分子景观分析发现这类患者集中在MSS患者中,是MSS结直肠癌患者中的一个独特亚型。在一例临床案例中也表明了克唑替尼药物治疗ROS1基因融合的患者是有一定的抗肿瘤疗效,但在治疗后会出现耐药进展,该案例表明KRAS可能是其耐药机制。

现有文献表明ROS1基因融合出现在MSS结直肠癌患者,对于这一类患者可以检测ROS1融合情况,明确药物敏感性,在一线治疗耐药后可以尝试相应的靶向药物。

阔然基因的结直肠癌用药指导基因检测套餐可以检测结直肠癌发生发展相关基因,包括NCCN指南推荐检测基因、获批药物以及处于临床试验药物等靶向药物相关基因、MSI/MMR以及与免疫治疗疗效相关基因、以及遗传性结直肠癌相关基因,助力临床精准诊疗!


参考文献

1. Ettinger DS, Wood DE, Aisner DL, Akerley W, Bauman JR, Bharat A, Bruno DS, Chang JY, Chirieac LR, D'Amico TA, Dilling TJ, Dowell J, Gettinger S, Gubens MA, Hegde A, Hennon M, Lackner RP, Lanuti M, Leal TA, Lin J, Loo BW Jr, Lovly CM, Martins RG, Massarelli E, Morgensztern D, Ng T, Otterson GA, Patel SP, Riely GJ, Schild SE, Shapiro TA, Singh AP, Stevenson J, Tam A, Yanagawa J, Yang SC, Gregory KM, Hughes M. NCCN Guidelines Insights: Non-Small Cell Lung Cancer, Version 2.2021. J Natl Compr Canc Netw. 2021 Mar 2;19(3):254-266. doi: 10.6004/jnccn.2021.0013. PMID: 33668021.
2. Shaw AT, Ou SH, Bang YJ, Camidge DR, Solomon BJ, Salgia R, Riely GJ, Varella-Garcia M, Shapiro GI, Costa DB, Doebele RC, Le LP, Zheng Z, Tan W, Stephenson P, Shreeve SM, Tye LM, Christensen JG, Wilner KD, Clark JW, Iafrate AJ. Crizotinib in ROS1-rearranged non-small-cell lung cancer. N Engl J Med. 2014 Nov 20;371(21):1963-71. doi: 10.1056/NEJMoa1406766. Epub 2014 Sep 27. PMID: 25264305; PMCID: PMC4264527.
3. He X, Jiao XD, Liu K, Qin BD, Wu Y, Ling Y, Liu J, Xu AQ, Song K, Zang YS. Clinical Responses to Crizotinib, Alectinib, and Lorlatinib in a Metastatic Colorectal Carcinoma Patient With ALK Gene Rearrangement: A Case Report. JCO Precis Oncol. 2021 May 3;5:PO.20.00534. doi: 10.1200/PO.20.00534. PMID: 34036227; PMCID: PMC8140796.
4. Pietrantonio F, Di Nicolantonio F, Schrock AB, Lee J, Tejpar S, Sartore-Bianchi A, Hechtman JF, Christiansen J, Novara L, Tebbutt N, Fucà G, Antoniotti C, Kim ST, Murphy D, Berenato R, Morano F, Sun J, Min B, Stephens PJ, Chen M, Lazzari L, Miller VA, Shoemaker R, Amatu A, Milione M, Ross JS, Siena S, Bardelli A, Ali SM, Falcone A, de Braud F, Cremolini C. ALK, ROS1, and NTRK Rearrangements in Metastatic Colorectal Cancer. J Natl Cancer Inst. 2017 Dec 1;109(12). doi: 10.1093/jnci/djx089. PMID: 29370427.
5. Akhoundova D, Hussung S, Sivakumar S, Töpfer A, Rechsteiner M, Kahraman A, Arnold F, Angst F, Britschgi C, Zoche M, Moch H, Weber A, Sokol E, Fritsch RM. ROS1 genomic rearrangements are rare actionable drivers in microsatellite stable colorectal cancer. Int J Cancer. 2022 Dec 15;151(12):2161-2171. doi: 10.1002/ijc.34257. Epub 2022 Aug 30. PMID: 36053834.
6. Huang RSP, Haberberger J, Sokol E, Schrock AB, Danziger N, Madison R, Trabucco S, Jin D, Pavlick D, Ramanan V, Hole K, McGregor K, Venstrom J, Ross JS. Clinicopathologic, genomic and protein expression characterization of 356 ROS1 fusion driven solid tumors cases. Int J Cancer. 2021 Apr 1;148(7):1778-1788. doi: 10.1002/ijc.33447. Epub 2020 Dec 23. PMID: 33336398.Davare MA, Henderson JJ, Agarwal A, Wagner JP, Iyer SR, Shah N, Woltjer R, Somwar R, Gilheeney SW, DeCarvalo A, Mikkelson T, Van Meir EG, Ladanyi M, Druker BJ. Rare but Recurrent ROS1 Fusions Resulting From Chromosome 6q22 Microdeletions are Targetable Oncogenes in Glioma. Clin Cancer Res. 2018 Dec 15;24(24):6471-6482. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-1052. Epub 2018 Aug 31. PMID: 30171048; PMCID: PMC6295214.







评论
2022年10月31日
李喜茹
山西省中西医结合医院 | 肿瘤内科
0.084%的结直肠癌患者中出现ROS1基因融合,并且对融合断点和伴侣进行具体分析。从分子景观分析发现这类患者集中在MSS患者中,是MSS结直肠癌患者中的一个独特亚型。在一例临床案例中也表明了克唑替尼药物治疗ROS1基因融合的患者是有一定的抗肿瘤疗效,但在治疗后会出现耐药进展,该案例表明KRAS可能是其耐药机制。 现有文献表明ROS1基因融合出现在MSS结直肠癌患者,对于这一类患者可以检测ROS1融合情况,明确药物敏感性,在一线治疗耐药后可以尝试相应的靶向药物。 阔然基因的结直肠癌用药指导基因检测套餐可以检测结直肠癌发生发展相关基因,包括NCCN指南推荐检测基因、获批药物以及处于临床试验药
2022年10月31日
李玉洋
莱州市人民医院 | 肿瘤内科
遗传性结直肠癌相关基因,助力临床精准诊疗
2022年10月31日
陈海峰
绍兴第二医院 | 肿瘤内科
感谢分享,受益良多